18/01 - Clémence Frioux (PLEIADE) : Modélisation discrète du métabolisme, des organismes individuels aux écosystèmes microbiens

Les réseaux métaboliques à l'échelle du génome rassemblent le potentiel fonctionnel associé au génome d'un organisme. Combinés à des modélisations mathématiques, ils permettent de prédire la réponse métabolique d'une espèce dans son environnement. Il y a eu de nombreux développements d'outils et de logiciels dédiés à la reconstruction et à l'analyse de tels modèles. L'objectif de cet exposé est la modélisation discrète de la productibilité métabolique à l'aide d'une approche booléenne, et ses applications.

J'illustrerai comment une telle approche complète les méthodes quantitatives en fournissant des informations sur le métabolisme des organismes, même à partir de réseaux métaboliques automatiquement reconstruits. Je montrerai comment de telles approches peuvent s'étendre à de grandes communautés d'organismes et tirer parti des données métagénomiques afin de cribler le potentiel métabolique du microbiote et d'identifier les membres clés parmi eux.