12/04 - Samuel Chaffron (Tara Oceans) : Les Modèles De Réseau De Plancton

Les modèles de réseau de plancton révèlent des mécanismes qui façonnent l'assemblage de la communauté microbienne dans l'océan mondial

Le plancton marin forme des communautés complexes d'organismes en interaction à la base du réseau trophique, qui soutiennent les cycles biogéochimiques océaniques et aident à réguler le climat. Comprendre les mécanismes contrôlant leur assemblage et entretenant leurs activités est un enjeu majeur en écologie microbienne. Bien que des études mondiales commencent à révéler les facteurs écologiques sous-jacents à la structure de la communauté planctonique et aux réponses prévues au changement climatique, on ne sait pas exactement comment les interactions entre les espèces à l'échelle de la communauté sont limitées et comment elles seront affectées par le changement climatique. En exploitant les données méta-omiques de Tara Oceans, les modèles de réseaux communautaires de plancton ont été intégrés à la modélisation de niche pour révéler les réponses des communautés de plancton spécifiques au biome aux changements environnementaux et prévoir les lignées les plus touchées au sein de chaque communauté.

Pour aller au-delà des modèles statistiques, les réseaux communautaires résolus sur le génome permettent de modéliser et de prédire les croisements métaboliques au sein des assemblages procaryotes. Cela a révélé un potentiel plus élevé d'interactions au sein des communautés prédites et a indiqué des alimentations croisées métaboliques spécifiques façonnant les communautés microbiennes du plancton. Les modèles écologiques et métaboliques intégrés fournissent un cadre utile pour évaluer la structure des communautés et les interactions des organismes, et révèlent des mécanismes importants qui façonnent les communautés microbiennes naturelles dans notre océan en mutation.